Здесь суточная порции сырья прогревается до технологической температуры, активизируется аборигенная микрофлора, происходит частичное удаление кислорода, мешающего метаногенным бактериям. В станцию подготовки при необходимости могут быть внесены закваски, пищевые добавки, специальные энзимы и скоропортящиеся компоненты, которые нельзя добавлять в приёмный бункер.
Станция подготовки оснащена эффективной системой подогрева сырья за счет тепловой рубашки большой площади и системы перемешивания. Для контроля за изменением температуры подогреваемого сырья установлены датчики температуры как внутри СПН, так и внутри тепловой рубашки. Для четкого определения количества сырья в СПН установлен датчик уровня особой конструкции собственной разработки.

Определённая модель Станции подготовки подбирается в зависимости от нескольких факторов:
1. Тип органического сырья, его влажность.
2. Количество одновременно сбраживаемых отходов.
3. Время на нагрев одной порции.
4. Температурный режим сбраживания.
5. Количество загрузок биореактора в сутки.

— СПН-2 (до 2 тонны отходов в сутки влажностью 92%),
— СПН-5 (до 10 тонн готовой смеси для сбраживания),
— СПН-60 ( до 100 тонн сырья в сутки)