«Мастер-Микрочип» анализирует полученное со сканера изображение и, используя специальный алгоритм сравнения интенсивности сигналов, делает заключение о наличии клинически значимых мутаций гена CFTR, а также о гомо- или гетерозиготности пациента по этим мутациям.

Кроме того, программное обеспечение позволяет сохранять результаты анализа на компьютере, дополнять их информацией о пациенте и учреждении, проводившем исследование, и конечно, при необходимости, распечатывать эти данные.